中级会计第二年单位变了

没影响。更换单位对于考中级会计证书是没有什么影响的。会计中级职称考试报名后换了工作单位的，领证的时候需要单位的盖章，以领证时所在的单位为准，同时应及时办理从业资格信息变更手续。